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COURS - Virologie

Virologie
Université Pierre et Marie Curie
Virologie
Niveau DCEM1
Jean-Marie Huraux
Avec la participation de Henri Agut, Anne-Marie Fillet
Vincent Calvez, Vincent Thibault, Agnès Gautheret-Dejean
Anne-Geneviève Marcelin, Claire Deback


Sommaire :


 Introduction
 1 Introduction générale et buts de l’enseignement de la virologie en DCEM1
 2 Conseils du Pr J.M. Huraux aux Étudiants pour les examens
 3 Objectifs de l’enseignement de virologie aux étudiants en médecine
 3.1 Objectifs généraux
 3.2 Objectifs particuliers aux différents virus d’intérêt médical

 3.3 Démarches diagnostiques, épidémiologiques et préventives
 4 Liste de questions rédactionnelles pour l’examen de DCEM-1 2007

 Chapitre 1 : Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales

 1.1 Qu’est-ce qu’un virus ?
 1.1.1 Génome
 1.1.2 Capside
 1.1.3 Enveloppe ou péplos
 1.1.4 Classification des virus
 1.1.5 Agents des encéphalopathies spongiformes transmissibles ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)
 1.2 Multiplication des virus
 1.2.1 Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
 1.2.2 La multiplication d’un virus comporte six étapes
 1.2.3 Conséquences de la multiplication virale pour la cellule infectée
 1.3 Moyens de défense contre l’infection virale
 1.3.1 À la frontière, la peau et les muqueuses
 1.3.2 Immunité naturelle, innée
 1.3.3 Immunité acquise, spécifique
 1.3.4 Interactions et « ambivalence » des moyens de défenses
 1.3.5 Immunodépression et infections virales
 1.3.6 Échappement des virus aux défenses immunitaires
 1.4 Expression clinique de l’infection
 1.4.1 Infections aiguës
 1.4.2 Infections chroniques
 1.5 Lutte contre les infections virales
 1.5.1 Immunothérapie passive
 1.5.2 Immunothérapie active
 1.5.3 Chimiothérapie antivirale
 1.5.4 Mesures d’hygiène : last but not least
 1.6 Points importants

 Chapitre 2 : Les Herpesviridae - 1ère partie (HSV et VZV)

 2.1 Généralités sur les Herpesviridae
 2.2 Les deux virus de l’herpès, ou herpes simplex virus type 1 et type 2 (HSV-1, HSV2)
 2.2.1 L’HSV-1 et l’HSV-2 se partagent le corps
 2.2.2 Manifestations habituelles des infections à HSV-1
 2.2.3 Herpes simplex virus type 2 (HSV-2)
 2.2.4 Infections graves
 2.2.5 Diagnostic au laboratoire de virologie des infections à HSV-1 et HSV-2
 2.2.6 Traitement
 2.2.7 Points importants
 2.3 Virus de la varicelle et du zona (VZV)
 2.3.1 Varicelle
 2.3.2 Zona
 2.3.3 Transmission de l’infection à VZV
 2.3.4 Diagnostic
 2.3.5 Traitement des infections à VZV
 2.3.6 Points importants

 Chapitre 3 : Les Herpesviridae - 2ème partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)

 3.1 Le cytomégalovirus humain (HCMV ou plus couramment CMV)
 3.1.1 Le virus
 3.1.2 Épidémiologie
 3.1.3 Infection du nouveau-né
 3.1.4 L’adulte immunocompétent
 3.1.5 Les personnes immunodéprimées
 3.1.6 Diagnostic au laboratoire
 3.1.7 Prévention et traitement
 3.1.8 Points importants
 3.2 Le virus Epstein-Barr (virus E-B ou EBV)
 3.2.1 Historique
 3.2.2 Mononucléose infectieuse
 3.2.3 Physiopathologie de la mononucléose infectieuse
 3.2.4 Infection latente
 3.2.5 EBV et cancer
 3.2.6 Diagnostic de l’infection par EBV et de la mononucléose infectieuse au laboratoire
 3.2.7 L’EBV, outil de laboratoire
 3.2.8 Points importants
 3.3 Herpèsvirus humain type 6 ou HHV-6
 3.4 Herpèsvirus humain type 8 ou HHV-8
 3.5 Herpesvirus simiæ ou virus B du singe

 Chapitre 4 : Rétrovirus humains - 1ère partie (le VIH ou HIV)

 4.1 Introduction : généralités sur les rétrovirus
 4.2 L’HIV ou VIH, virus de l’immunodéficience humaine
 4.2.1 Structure du virus
 4.2.2 Cycle de multiplication de l’HIV au niveau de la cellule
 4.2.3 La multiplication virale au niveau de l’organisme
 4.2.4 Épidémiologie
 4.2.5 L’HIV-2
 4.2.6 Diagnostic virologique et suivi au laboratoire de l’infection à VIH
 4.2.7 Thérapeutique antivirale
 4.2.8 Prospective
 4.2.9 Points importants

 Chapitre 5 : Rétrovirus humains - 2ème partie (HTLV) et virus des hépatites - 1ère partie (hépatite A - VHA ou HAV, hépatite B - VHB ou HBV)

 5.1 Rétrovirus humains - 2ème partie : HTLV
 5.2 Les « virus des hépatites »
 5.3 Caractères généraux des hépatites virales aiguës
 5.4 Le virus de l’hépatite A (VHA ou HAV)
 5.5 Le virus de l’hépatite B (VHB ou HBV)
 5.5.1 Structure du virus
 5.5.2 Multiplication
 5.5.3 La transmission de l’HBV
 5.5.4 Histoire naturelle de l’infection et évolution des antigènes, des anticorps et de l’ADN viral dans le sérum
 5.5.5 Traitement
 5.5.6 Un problème très important de santé publique
 5.5.7 HBV et mutations
 5.6 Points importants

 Chapitre 6 : Virus des hépatites - 2ème partie

 6.1 Le virus delta ou virus de l’hépatite D (HDV)
 6.2 Le virus de l’hépatite C (HCV)
 6.2.1 Le virus
 6.2.2 Épidémiologie et histoire naturelle
 6.2.3 Diagnostic
 6.2.4 Le traitement
 6.3 Le virus de l’hépatite E ou HEV
 6.4 Le virus dit de l’hépatite G et le TTV
 6.5 Points importants

 Chapitre 7 : Les virus respiratoires - 1ère partie

 7.1 Virus de la grippe ou virus influenza
 7.1.1 Clinique de la grippe
 7.1.2 Parcours du virus de la grippe dans l’organisme
 7.1.3 Morts par grippe
 7.1.4 Virus de la grippe ou virus influenza et modifications antigéniques
 7.1.5 Diagnostic au laboratoire
 7.1.6 Traitement et prévention de la grippe
 7.1.7 Points importants

 Chapitre 8 : Les virus respiratoires - 2ème partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubéole

 8.1 Virus respiratoires (2ème partie)
 8.1.1 Généralités sur la famille des Paramyxoviridae
 8.1.2 Les virus para-influenza
 8.1.3 Virus respiratoire syncytial
 8.1.4 Coronavirus
 8.1.5 Rhinovirus
 8.2 Virus des oreillons ou virus ourlien
 8.2.1 Le virus
 8.2.2 Diagnostic virologique
 8.2.3 Traitement
 8.3 Virus de la rougeole
 8.3.1 Manifestations cliniques
 8.3.2 Diagnostic virologique
 8.3.3 Vaccin
 8.4 Points importants
 8.5 Virus de la rubéole
 8.5.1 Le virus
 8.5.2 Primo-infection rubéolique
 8.5.3 Réinfection rubéolique
 8.5.4 Rubéole congénitale
 8.5.5 Conduite à tenir chez une femme enceinte
 8.5.6 Récapitulatif des dates des prélèvements et des indications de la recherche des IgM rubéoliques
 8.5.7 Traitement
 8.5.8 Points importants

 Chapitre 9 : Entérovirus et virus des gastroentérites

 9.1 Entérovirus
 9.1.1 Généralités sur les entérovirus
 9.1.2 Poliomyélite et poliovirus
 9.1.3 Échovirus et coxsackievirus
 9.2 Virus des gastroentérites
 9.2.1 Rotavirus
 9.2.2 Petits virus nus à ARN responsable de gastroentérites
 9.2.3 Adénovirus des gastroentérites
 9.3 Points importants

 Chapitre 10 : « Autres virus à ADN » : adénovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus

 10.1 Adénovirus
 10.1.1 Clinique
 10.1.2 Diagnostic au laboratoire
 10.1.3 Pouvoir cancérigène des adénovirus
 10.1.4 Traitement
 10.2 Papovavirus
 10.2.1 Généralités
 10.2.2 Famille des Polyomaviridae
 10.2.3 Famille des Papillomaviridae
 10.3 Parvovirus
 10.4 Poxvirus
 10.4.1 Généralités
 10.4.2 Variole
 10.4.3 Vaccine
 10.4.4 Actualité de la variole
 10.4.5 Poxviroses professionnelles
 10.4.6 Monkey pox
 10.4.7 Molluscum contagiosum
 10.5 Points importants
 10.5.1 Adénovirus ou ADV
 10.5.2 Polyomavirus humains, BK et JC virus
 10.5.3 Papillomavirus humains ou HPV
 10.5.4 Parvovirus humain B19
 10.5.5 Poxvirus

 Chapitre 11 : Agents des encéphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)

 11.1 Des maladies extraordinaires
 11.2 Des agents extraordinaires
 11.3 L’hypothèse du prion ou de la « protéine seule »
 11.4 ESB et nvMCJ
 11.5 Les différentes catégories de MCJ

 Chapitre 12 : Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits émergents

 12.1 Virus de la rage
 12.1.1 Le virus rabique
 12.1.2 Réservoir du virus
 12.1.3 La contamination de l’homme
 12.1.4 Trajet du virus
 12.1.5 Signes de la rage
 12.1.6 Mesure à prendre
 12.1.7 Points importants
 12.2 Arbovirus
 12.2.1 Définition
 12.2.2 Parcours habituel du virus dans l’organisme
 12.2.3 Fièvre jaune (virus amaril)
 12.2.4 Encéphalites à arbovirus
 12.2.5 La dengue
 12.2.6 Points importants
 12.3 Infections à forte mortalité par filovirus, arénavirus, et hantavirus et autres virus émergents
 12.3.1 Les filovirus : le virus Marburg et le virus Ebola
 12.3.2 Les arénavirus
 12.3.3 Le virus Hantaan
 12.3.4 Conditions de manipulation
 12.4 En guise de conclusion au cours de virologie médicale
 Annexe A : Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique
 Annexe B : Calendrier vaccinal 2005
 B.1 Nouvelles recommandations
 B.2 Recommandations générales
 B.3 Risques professionnels
 B.4 Recommandations particulières
 B.5 Recommandations vaccinales aux voyageurs
 Annexe C : Récapitulatif : diagnostic, prévention, traitement
 Annexe D : Aide-mémoire de chimiothérapie antivirale
 Annexe E : Les examens virologiques en pratique médicale
 E.1 Diagnostic des infections virales
 E.1.1 Deux approches
 E.1.2 Diagnostic direct
 E.1.3 Diagnostic indirect
 E.2 Rôle du praticien
 E.2.1 Les prélèvements
E.2.2 Renseignements cliniques et interprétation des résultats
 E.2.3 Indication des examens virologiques en pratique médicale
 E.3 Quantification de la virémie, « seuil d’intervention » et « traitement anticipé » (preemptive)
 E.4 Suivi des traitements antiviraux
 E.5 Conclusion
 Annexe F : Recommandations de traitement pour hépatite chronique
 Annexe G : Vingt ans après
 Annexe H : Évaluation de l’enseignement de la virologie. Année 2007
 Annexe I : Remerciements


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Ditulis oleh: younes younes - mercredi 15 août 2012

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